雪之国，冰之虹壁，常年因积雪覆盖而出名，不过眼下正是五月初夏，在那蒸汽机的作用下，冰雪融化，溪流潺潺，四下里花草丛生，引来无数蝴蝶在其间翩翩起舞，大人、儿童都是满面笑容，闲暇的时候，便三五一群、五个一伙的相约结伴来到这里，载歌载舞。
而叶清则躺在一条小溪前望着天空，静静的享受这一片阳光柔和下午。说起来这是他从木叶回来两天了，写轮眼被叶清用自然ckl完整的取了下来，而团藏的狗头则随意的扔进哪个山沟。
在雨硫的帮助下，叶清换上了右眼写轮眼，顿时感觉两只眼睛传来巨大的瞳力，叶清感受着这股瞳力，强大而又源源不断的在两只写轮眼周围循环，叶清试着将自然ckl输送进去，果然并没有引起写轮眼的排斥。
“哈哈，看来自己也获得了一对永恒写轮眼呢！却不知这两只眼睛的能力如何，真是迫不及待啊！”，虽然这么说但叶清还是按捺下自己心中的躁动，闭着眼睛安静的躺着，根据他的判断，在自己自然ckl的滋养下，右眼的融合应该也就是三天左右，今天已经是第三天了，过了今晚自己可就能拆掉纱布，肆无忌惮的使用写轮眼了！
叶清就这样在草地上躺着，看着天上的日头一点一点的西沉，渐渐地黑夜来临了.....
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另一边，木叶第七班成员因为察觉到木叶峡谷的骚luan而赶到，却被眼前看到的一幕震惊，团藏死无全尸，头颅不知所踪，而凶手貌似就是第七班昔日的队员宇智波佐助，于是鸣人愤怒的cao使螺旋丸冲了过来，而佐助也不甘示弱，千鸟发动，两个人的绝招碰在一起，引发各自体内的ckl激荡，开辟出一个精神空间。
佐助和鸣人就着一系列事件讨论，因为经历不同所以不欢而散，鸣人想留下佐助，佐助却不愿意回头，而且他自称杀死了团藏，所以绝了回木叶的念头，接着阿飞出现带走了佐助和其他cf小队成员。
之后，佐助带领cf小队继续追查宇智波灭族的真相，因为佐助他从团藏的只言片语中获悉当年的宇智波灭族行动另有隐情，并且也和阿飞所说的信息有些出入，佐助怀疑自己被阿飞骗了，便自行脱离晓组织并试图复活知晓当年宇智波与木叶恩怨的历代火影，而复活他们需要解开尸鬼封尽，而大蛇丸研究尸鬼封尽很多年了，佐助相信以大蛇丸的才智一定有破解尸鬼封尽的方法。所以为了复活大蛇丸，佐助决定先去木叶抓到御手洗红豆，因为她身上有着大蛇丸遗留在世上的最后一个天之咒印，那里面残留的虽然只是大蛇丸的残魂，但用来复活大蛇丸足够了。
阿飞则独自前往田之国找到了药师兜，此时药师兜已经融合大蛇丸细胞变成一只蛇不蛇、人不人的玩意，两者就摧毁木叶达成统一战线，于是在阿飞提供的十万白绝分身的帮助下，药师兜发动秽土转生，召唤出五大国的历代影与强者，正式拉开第四次忍界大战。
而纲手也恰好从昏迷中醒来，重新召开了五影大会，后决定成立忍者联军，因为团藏身死，根的成员身上的咒印全部消失，便彻底的投向第五代火影，纲手也向外宣布团藏执政期间的一切政令作废，其中包括把宇智波佐助视为叛忍以及通缉风神叶清的命令，而鸣人被大和等人秘密护送到云隐村的龟岛隐藏，至于鸣人没有了奇拉比的帮助是否还能驯服九尾那就听天由命吧。理论上还是能成功的，因为鸣人体内还有他老妈漩涡玖辛乃。
很快，阿飞与药师兜的十万秽土转生大军开始进攻，五影纷纷回到各自村子成立忍者联军，加上铁之国武士总共约有八万忍者，废弃了之前的各村护额而是换上了统一的“忍”自护额，继而五影通过电视会议确认了忍者联军的任命：
最高统帅是第四代雷影艾，纲手做总参谋，副参谋是鹿丸的老爸奈良鹿久和麻布伊，联军的总指挥则是我爱罗。
奇袭部队由队长旗木良友带领，他本是木叶第九班的下忍。后来因病来到雷之国治疗，后来为了继续开发雷遁便加入了云隐村，迅速成长为一名精英上忍，因为表现优异又天赋异禀被第四代雷影收为关门弟子，手下还有副队长勘九郎、奥摩依、佐井、一反、日向火门、段吾、佐治和铜等。
医疗后勤部队则是队长静音，她是木叶五代火影的近侍，手下还有副队长千手月（第九班成员），春野樱、白医、竹丸、户善、硫磺、日野等。
情报部队则是队长山中亥一，副队长山城红叶、天画、茶新味、户之、森罗丸等，还有一个感知部队则是由具有一只白眼的青担任，跟着希、掘削等人。
大名护卫队的统领是水影照美幂，带领长十郎、啡雷神间、并足雷同、榻榻米伊瓦西等人。
除此之外，忍者联军还分成五个分队，第一分队队长达鲁伊，中距离联合军分队，主力为擅长暗器和武器的忍者。第二队长黄土，近战联合军分队，负责斩杀数量众多的敌人，战斗在最前线的队伍。
第三队长旗木卡卡西，战斗近中距离联合军分队，负责持久战，只有兼备体力和速度的忍者才能胜任。第四队长我爱罗兼总指挥，奈良鹿丸作为随军参谋，远距离战斗联合军分队，同时负责支援前线及后方的部队。
第五队长三船，号称战斗特别部队，里面全都是武士或者使用特殊忍术、战斗方法的忍者们组成的部队。